Javier Marín San Andrés nació el 3 de octubre de 1958 en Madrid; es ingeniero superior aeronáutico por la Universidad Politécnica de Madrid, diplomado en Dirección Económica y Financiera por la Cámara de Comercio de Madrid y Graduado en Alta Dirección (PADE) por el IESE.

Se incorporó a AENA en 1991, y entre 1993 y 1996 fue director general de Navegación Aérea. En 1997 fue nombrado director de Desarrollo Corporativo, siendo el responsable de la planificación estratégica de la entidad y ocupándose, entre otros proyectos, del inicio del desarrollo internacional de AENA como operador de aeropuertos y navegación aérea.

En la actualidad, es director de Aeropuertos Españoles de la Entidad Pública Empresarial Aeropuertos Españoles y Navegación Aérea (AENA), siendo responsable del desarrollo y la gestión de la red de aeropuertos españoles. Así mismo es vicepresidente del Consejo de Administración de CLASA (Centros Logísticos Aeroportuarios, S.A).

En 1999 fue nombrado consejero delegado y director general de Aena Internacional, sociedad filial para la participación en la gestión de infraestructuras aeronáuticas fuera de España.

Previamente a su incorporación en AENA, y desde la finalización de sus estudios, prestó sus servicios en la Universidad Politécnica de Madrid, en la Dirección General de Aviación Civil, en el Centro Experimental de París de la Organización Eurocontrol, así como en el grupo empresarial Indra.